Проблема в 1с8.3 Программа в счет-фактуре вносит тариф с ндс

Наша бухгалтерия столкнулась с проблемой при переходе с 8.2 на 8.3. При выставлении счет-фактуры, должен вноситься тариф без учета ндс, но программа думает что эта сумма уже с Ндс и в итоге делает расчеты с погрешностью.
Сама я не бухгалтер, да и они не понимают что же надо сделать, чтобы применялся другой способ расчета НДС.
Может кто сталкивался с проблемой и поможет объяснить, в чем же загвоздка?